Jean-Paul Armspach
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Coordonnées
Jean-Paul ARMSPACH
Université de Strasbourg/Faculté de Médecine
Institut Physique Biologique- ICube
4, rue Kirschleger
F-67085 Strasbourg Cedex (FRANCE)
Téléphone : (+33) (0) 3 68 85 40 41
Né le : 14 Février 1955
Adresse électronique : jparmspach@unistra.fr
Internet : http://ipb.u-strasbg.fr/staff/armspach/armspach.html
Titres universitaires
Année | Diplôme | Etablissement | Ville |
---|---|---|---|
1975 | D.U.T. | Université Haute Alsace | Mulhouse |
1978 | Ingénieur spécialisation génie électrique | INSA | Lyon |
1982 | Docteur Ingénieur Titre : Etude et réalisation d'un appareil de tomographie par RMN du proton. | INSA | Lyon |
1992 | Doctorat d'état Titre : Analyse des images RMN pour la caractérisation des tissus. | Université Louis Pasteur | Strasbourg |
Parcours professionnel
Lieu/Grade | Année | Fonctions |
---|---|---|
Institut Physique Biologique (IPB) Ingénieur |
1979 à 1982 | Conception et réalisation du premier appareil d'imagerie par résonance magnétique nucléaire en France permettant de visualiser des petits objets (orange, champignon, avant-bras, ..) |
Faculté de Médecine – Institut Physique Biologique (IPB) Ingénieur d'études |
1982 à 1992 | Responsable du service informatique de la Faculté de Médecine. Recherche dans le domaine de l'analyse du signal RMN pour la caractérisation des tissus par IRM. |
Institut Physique Biologique – CNRS UMR 7004 Ingénieur de recherche |
1993 à 2006 | Responsable du groupe de recherche en Traitement d'Images Médicales. |
LINC-IPB UdS/CNRS UMR 7237 Ingénieur de recherche |
2007 à 2012 | Responsable de l'équipe de recherche « Imagerie In Vivo ». Directeur de la plate-forme d’imagerie in vivo de strasbourg – campus médecine. |
ICube-IPB UdS/CNRS UMR 7357 Ingénieur de recherche |
2013 à | Responsable de l'équipe de recherche « Imagerie Multimodale Intégrative en Santé (IMIS) ». Directeur de la plate-forme d’imagerie in vivo de Strasbourg – campus médecine. |
Thématiques de recherche
- Traitement d'images médicales
- Segmentation d'images 3D multimodales.
- Détection statistiques de changement en imagerie multi-modales 3D+t.
Directeur de thèses
- Lucas Soustelle. Imagerie de la myéline par IRM à temps d’écho ultra-court. Co-direction de thèse avec Francois Rousseau. Co-encadrement avec Paulo Loureiro de Sousa (depuis octobre 2014). Financement : contrat doctoral UdS.
- Marion Sourty. Analyse de la dynamique temporelle et spatiale des réseaux cérébraux spontanés obtenus en imagerie par résonance magnétique fonctionnelle IRMf. Co-direction de thèse avec Jack Foucher. Co-encadrement avec Laurent Thoraval (depuis octobre 2012). Financement : contrat doctoral UdS.
- Francois Lavigne. Segmentation statistique 3d+t d’images IRM multimodales pour la quantification de la charge lésionnelle. Co-direction de thèse avec Christophe Collet. (depuis octobre 2011). Financement : contrat doctoral UdS.
Directeur de thèses soutenues
- Valérie Wolff (PH - HUS). Physiopathologie et thérapeutique de l’infarctus cérébral du sujet jeune : rôle de la résine de cannabis dans l’atteinte vasculaire et l’altération mitochondriale cérébrale. Co-direction de thèse avec Bernard Gény. (depuis octobre 2011).
- Détection de changements en IRM de diffusion et du tenseur de diffusion. Application à la détection aux pathologies cérébrales. (thèse soutenue 2012 : A. Grigis co-encadrement avec F. Heitz , ICube et V. Noblet , ICube ).
- Etude de la substance blanche cérébrale de l'enfant par imagerie en tenseur de diffusion. (thèse soutenue le 12 Avril 2012 : M. Koob co-encadrement avec JL. Dietemann , ICube )
- Indexation de spectres HSQC et d'images IRMf appliquée à la détection de bio-marqueurs. (thèse soutenue le 30 Mars 2012 : A. Belghith co-encadrement avec C. Collet , ICube )
- Estimation de l'atrophie cérébrale en imagerie par résonance magnétique : Application à la sclérose en Plaques (thèse soutenue en Septembre 2011 : S. Sharma co-encadrement avec F. Heitz , ICube et F. Rousseau, ICube ).
- Detection automatique de changements en IRM de diffusion : Application à l'étude longitudinale en sclérose en plaques. (thèse soutenue en Juillet 2010 : H. Boisgontier co-encadrement avec F. Heitz , ICube et V. Noblet , ICube ).
- Segmentation d'images IRM anatomiques multimodales couplant inférence bayésienne et modèles a priori de haut niveau. (thèse soutenue en novembre 2008 : S. Bricq co-encadrement avec C. Collet , ICube ).
- Présentations compactes et apprentissage non supervisé de variétés non linéaires. Application au traitement d'images. (thèse soutenue en Octobre 2008 : M. Brucher co-encadrement avec F. Heitz , ICube et C. Heinrich , ICube ).
- Atlas statistique anatomique du cerveau humain. Application au recalage, à la segmentation et à l'aide au diagnostic. (thèse : Vincent NOBLET , soutenue en Mars 2006).
- Analyse et fusion markovienne de séquences en imagerie 3D+t. Application à l'analyse de séquences d'images IRM fonctionnepicabialles cérébrales (thèse : S. Faisan , soutenue en Décembre 2004).
- Modèles statistiques d'apparence 3D. Application à la création d'un atlas probabiliste de perfusion cérébrale pour l'aide au diagnostic. (thèse : T. Vik , soutenue Septembre 2004).
- Détection de changements dans des séquences d'images médicales 3D multimodales. Application à la détection et au suivi des lésions du cerveau en sclérose en plaques. (thèse : M. Bosc , soutenue en Décembre 2003).
- Construction d'un atlas anatomique numérique probabiliste du cerveau humain en vue d'automatiser la localisation et l'étiquetage de régions anatomiques (thèse : O. Musse , soutenue en Décembre 2000).
- Recalage d'images médicales multimodales : approches par fonctions de similarité robustes et modèles déformables sous contraintes statistiques (thèse : C. Nikou , soutenue en Juin 1999).
Publications - Ouvrages
- 68 publications dans des revues internationales avec comité de lecture.
- 274 communications ou posters dans des congrès internationaux ou nationaux.
- Co-auteur de 3 ouvrages (Le système d'exploitation Unix - 1993 ; Unix. Cours et exercices corrigés - 1999 ; Linux - 2000).
- ISI Web of knowledge 2013 (124 articles, H-index : 18)
- liste des publications
Enseignement - Formation
- Cours informatique 2ième année école d’ingénieur Telecom Physique (Unix) (supports cours)
- Cours traitement images médicales 3ième année école ingénieur Telecom Physique, master recherche IRIV. (supports cours)
- Cours traitement images médicales 2ième et 3ième année école ingénieur Telecom Physique spécialisé TIC-Santé. (supports cours)
Responsabilités collectives
- Responsable de l'équipe de recherche Imagerie Multimodale Intégrative en Santé (IMIS) de Icube.
- Directeur de la plateforme d'imagerie in vivo de strasbourg - campus médecine.
- Responsable de l'équipe de recherche Imagerie in vivo du LINC (2007-2012).
- Responsable de l'équipe de recherche "traitement images médicales" du laboratoire de Neuroimagerie In Vivo - UMR 7004 (1994-2006).
- Responsable du service informatique de la Faculté de médecine de Strasbourg (1982-1992).
- Membre du bureau de ICube.
- Membre élu de la commission paritaire d'établissement (CPE) de l'UdS.
- Membre élu de la commission administrative paritaire nationale (CAPN).
- Membre du comité de pilotage de IRMC.
- Membre du comité de pilotage de ICube (2011-2012).